УДК: 616.34-022-036.11-036.22:578.5(476)
Год издания: 2014

Создание национальной системы молекулярно-эпидемиологического мониторинга за возбудителями норовирусной инфекции и базы данных их доминирующих генотипов

Поклонская Н.В.Амвросьева Т.В.Дедюля К.Л.Барановская Н.Н.Богуш З.Ф.Казинец О.Н.
Рубрики: 34.15.3176.03.4176.29.50
Республиканский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологии
Тема НИР: «Разработать систему молекулярно-эпидемиологического мониторинга за возбудителями норовирусной инфекции и изучить циркуляцию их генотипов на территории Республики Беларусь» ГНТП «Инфекции и микробиологические нанотехнологии».
Сроки выполнения НИР: январь 2013 г. — декабрь 2015 г.
Научный руководитель: Т.В. Амвросьева.
Источник финансирования: госбюджет.

Норовирусы (НоВ) являются одними из доминиру­ющих этиологических агентов острых кишечных ин­фекций (ОКИ) вирусной природы. В настоящее время по распространенности и частоте вызываемых ими за­болеваний среди детского контингента НоВ уступают только ротавирусам, тогда как среди взрослых, особен­но пожилых, они признаны главными этиологически­ми агентами ОКИ. Геном НоВ характеризуется высо­кой частотой мутаций, приводящих к регулярному воз­никновению новых вариантов вируса, способных бы­стро распространяться среди населения из-за отсут­ствия к ним иммунной прослойки. Среди многообразия циркулирующих НоВ выделяются отдельные их гено­типы или даже субгенотипы, обладающие наибольшей контагиозностью и способностью вызывать многочис­ленные вспышки ОКИ. Быстрое выявление генотипов с высоким эпидемическим потенциалом и предотвра­щение их распространения является главной задачей молекулярно-эпидемиологического надзора за НоВ.

Целью настоящего исследования была разработка и внедрение в практическое здравоохранение националь­ной системы молекулярно-эпидемиологического мони­торинга за циркулирующими на территории Республи­ки Беларусь возбудителями норовирусной инфекции (НоВИ) с последующим установлением эпидемически значимых их генотипов и созданием соответствующей базы данных.

В ходе исследований установлен стабильно высо­кий вклад НоВ в заболеваемость вирусными ОКИ в 2009-2012 гг. (около 20,5% среди детей и взрослых). Наибольшая доля гастроэнтеритов НоВ этиологии за­регистрирована у детей зимой 2011 г. (39,6%), наимень­шая - летом 2012 г. (7,3%). Показана доминирующая роль НоВ в развитии групповой заболеваемости: 81,8% эпизодов имели норовирусную этиологию, в т. ч. 72,7% были связаны с НоВ II геногруппы и 9,0% - с НоВ I ге­ногруппы (63,6% эпизодов НоВ оказались единствен­ными этиологическими агентами).

На основании обобщения и анализа теоретиче­ских и экспериментальных данных разработана наци­ональная система молекулярно-эпидемиологического мониторинга за возбудителями НоВИ, учитываю­щая особенности организации и функционирова­ния отечественного здравоохранения и существую­щей в республике системы эпиднадзора за инфекци­ями. Проведена адаптация и оптимизация методов молекулярно-эпидемиологических исследований, раз­работаны схема и алгоритм их использования с регла­ментацией показаний и порядка действий, объектов, методов, объемов и кратности исследований, а также с выдачей рекомендаций по оценке и интерпретации полученных результатов и указанием возможных про­блем в работе и путей их разрешения.

Изучена молекулярная эпидемиология НоВ, цир­кулировавших в 2009-2013 гг., установлены генетиче­ские характеристики этиологических агентов 7 эпизо­дов групповой заболеваемости НоВИ. Проведен фило­генетический анализ НоВ по 2-м информативным реги­онам генома и установлена генетическая структура их популяции: генотип GII.4 - 62,8%, GII.6 - 14,0%, GII.g-GII.12 - 11,6%, GII.g-GII.1 - 9,3%, GII.3 - 2,3%. Иден­тифицировано 2 рекомбинантных геноварианта НоВ, вызвавших спорадическую (GII.g-GII.12) и групповую (GII.g-GII.1) заболеваемость. Установлена циркуляция в Беларуси двух глобальных эпидемических геновари­антов НоВ в пределах доминирующего генотипа GII.4, вызвавших спорадическую (GII.4 2006b) и групповую (GII.4 New Orleans 2009) заболеваемость НоВИ.

На основании полученных данных создана и заре­гистрирована в Государственном регистре информаци­онных ресурсов «База данных о генотипах норовиру­сов, циркулирующих на территории Республики Бела­русь» (рег. свид. № 1761303599 от 02.09.2013), содер­жащая информацию о 157 НоВ, идентифицированных в 2009-2013 гг. в клиническом материале пациентов с НоВИ. Генетические характеристики включают инфор­мацию о геногруппе вируса (10 НоВ I геногруппы, в т. ч. 5 этиологических агентов вспышек и 5 споради­ческих случаев, а также 147 НоВ II геногруппы, из них 47 и 100 случаев соответственно). База данных содер­жит информацию о генотипе 41 НоВ, в т. ч. об 11 эти­ологических агентах вспышек и 30 НоВ, вызвавших спорадические случаи заболевания. Она включает сле­дующие генотипы: GII.4 (26 изолятов), GII.3 (1), GII.6 (5), G IIg/II.12 (5) GII.1 (2), GIIg(2). Нуклеотидные по­следовательности 44 НоВ депонированы в междуна­родный GenBank (коды доступа KC137572- KC137589, KC153243- KC153246, KF137566- KF137572, JQ036290-JQ036299).

Полученные результаты легли в основу разработ­ки инструкции по применению «Алгоритм лаборатор­ной диагностики норовирусной инфекции», утверж­денной в установленном порядке (рег. № 014-1213 от 25.03.2014). Инструкция предназначена для вирусоло­гов, эпидемиологов, лаборантов, врачей лабораторной диагностики. В ней изложены порядок осуществления лабораторной диагностики НоВИ в условиях споради­ческой и групповой заболеваемости, методы исследо­ваний и алгоритм их применения, включая рекоменда­ции по использованию результатов.


Область применения: клиническая лабораторная диагностика.
Рекомендации по использованию: разработанный алгоритм может быть использован в работе стационаров и отделений инфекционного профиля, а также лабораторий центров гигиены и эпидемиологии, располагающих соответствующим оборудованием и специалистами.
Предложения по сотрудничеству: консультативная и техническая помощь в генотипировании, филогенетическом и молекулярно-эпидемиологическом анализе возбудителей НоВИ.


в начало med.by баннеры учреждения авторы расширенный поиск
Достижения медицинской науки Беларуси.
Copyright © 1997-2024 НИО РНМБ
Вопросы и комментарии просьба отправлять Администратору сайта